Іске қосылғаннан кейін материал мұздату үшін материал резервуарына салынады. Мұздату процесі екі аспектіні қамтиды: біріншіден, вакуумдық жүйе вакуумды тарту арқылы біраз ылғалды кетіреді; екіншіден, материал қатқанда кейбір су молекулалары жер бетіне шығып, қатып қалады. Мұздату талаптары орындалғаннан кейін, жылыту жүйесі материалды қыздырады және кептіреді, қалған ылғалды кетіру үшін вакуумды тартады, содан кейін ол мұздату үшін мұздатқышқа апарылады, осылайша мұздату{2}}кептіру талабына жетеді.
Мұздатып{0}}кептіру сублимация арқылы мұздатылған биологиялық өнімдерден суды немесе басқа еріткіштерді кетіру процесін білдіреді. Сублимация су сияқты құрғақ мұз сияқты еріткіштің сұйық күйден өтпестен қатты күйден газ күйіне тікелей ауысу процесін білдіреді. Мұздатып кептіру-арқылы алынған өнім лиофилизатор деп аталады, ал процесс мұздатып кептіру-деп аталады. Дәстүрлі кептіру материалдың шөгуін тудырады және жасушаларды зақымдайды. Мұздатып кептіру-кезінде үлгінің құрылымы бұзылмайды, себебі қатты құрамдастарды өз орнындағы мұз ұстап тұрады. Мұз сублимацияланған кезде кептірілген қалдықтарда тесіктер қалдырады. Бұл өнімнің биологиялық және химиялық құрылымының және оның белсенділігінің тұтастығын сақтайды. Зертханада мұздатып кептіру{11}}көптеген әртүрлі қолданбаларға ие және көптеген биохимиялық және фармацевтикалық қолданбаларда қажет. Ол микробтық дақылдар, ферменттер, қан және фармацевтикалық препараттар сияқты ұзақ уақыт бойы сақталуы мүмкін, олардың ұзақ мерзімді тұрақтылығын ғана емес, сонымен бірге тән биологиялық белсенділігі мен құрылымын сақтай отырып, биологиялық материалдарды алу үшін қолданылады. Осы себепті лиофилизация тін үлгілерін құрылымдық зерттеулерге дайындау үшін қолданылады (мысалы, электронды микроскопия). Лиофилизация химиялық талдауда да қолданылады, кептірілген үлгілерді қамтамасыз етеді немесе аналитикалық сезімталдықты арттыру үшін үлгілерді концентрлейді. Лиофилизация үлгі компоненттерін олардың химиялық құрамын өзгертпестен тұрақтандырады, бұл оны тамаша аналитикалық көмекші етеді. Лиофилизация табиғи түрде болуы мүмкін. Табиғи жағдайда бұл процесс баяу және болжау мүмкін емес. Лиофилизация жүйелерін дамыту арқылы көптеген қадамдар жетілдірілді және нақтыланды, бұл процесті жылдамдатады.
